Esta formação/unidade curricular (UC) tem como objetivo introduzir os fundamentos da linguagem de programação R e a utilização do ambiente de desenvolvimento RStudio, com especial enfoque na análise estatística e exploração de dados biomédicos.
A abordagem será essencialmente prática, recorrendo a conjuntos de dados biomédicos reais, incluindo dados disponibilizados pelo The Cancer Genome Atlas (TCGA) e pela plataforma UCSC Xena, de forma a promover a aplicação dos conhecimentos a problemas concretos de investigação biomédica.
Ao longo da formação/UC, serão abordados progressivamente os seguintes conteúdos:
- Introdução ao R e RStudio: conceitos fundamentais de programação e utilização do ambiente de trabalho.
- Gestão e preparação de dados clínicos e biomédicos: importação, organização, transformação e tratamento de dados.
- Estatística descritiva e visualização de dados: exploração, sumarização e representação gráfica de dados.
- Inferência estatística: aplicação e interpretação de testes estatísticos, considerando os respetivos pressupostos.
- Modelação estatística e análise de sobrevivência: introdução a modelos estatísticos e métodos de análise de dados de sobrevivência.
- Análises reprodutíveis com R Markdown
A abordagem será essencialmente prática, recorrendo a conjuntos de dados biomédicos reais, incluindo dados disponibilizados pelo The Cancer Genome Atlas (TCGA) e pela plataforma UCSC Xena, de forma a promover a aplicação dos conhecimentos a problemas concretos de investigação biomédica.
Ao longo da formação/UC, serão abordados progressivamente os seguintes conteúdos:
- Introdução ao R e RStudio: conceitos fundamentais de programação e utilização do ambiente de trabalho.
- Gestão e preparação de dados clínicos e biomédicos: importação, organização, transformação e tratamento de dados.
- Estatística descritiva e visualização de dados: exploração, sumarização e representação gráfica de dados.
- Inferência estatística: aplicação e interpretação de testes estatísticos, considerando os respetivos pressupostos.
- Modelação estatística e análise de sobrevivência: introdução a modelos estatísticos e métodos de análise de dados de sobrevivência.
- Análises reprodutíveis com R Markdown
- Professor: Andreia Filipa Moreira Aguiar Brandão